Међу осталим активностима, Лабораторија за ихтиологију и морско рибарство спроводи праћење рибљих популација и појединих врста риба у заштићеним подручјима морског добра (MPA, Marine Protected Area), којима управља Јавно предузеће за управљање морским добром Црне Горе (ЈПМД).
Праћење се спроводи примјеном двије методе, на више одабраних локација унутар различитих зона заштите. Прва метода заснива се на визуелном цензусу (Underwater Visual Census, UVC) дуж трансекта. Ронилац се креће дуж унапријед дефинисане линије (или унапријед утврђене путање) и биљежи врсте и број јединки риба које уочи унутар појаса одређене ширине у односу на линију трансекта, на примјер два метра са обје стране. На тај начин добија се процјена бројности риба на тачно одређеној површини. У случајевима када се трансект не поставља унапријед, већ се путања одређује током узорковања, ронилац може користити GPS уређај ради биљежења трасе и дужине, а ти подаци се касније користе у анализи.

Друга метода је бројање у тачки (point count). Код ове методе ронилац се не креће, већ током унапријед дефинисаног временског периода, на примјер 10 минута, биљежи врсте и бројност риба унутар дефинисаног подручја око себе, на примјер круга полупречника три метра. Бројање почиње након кратког времена од спуштања рониоца, како би се рибе прилагодиле његовом присуству.
Узорковања се спроводе роњењем на дах (snorkelling) или роњењем са аутономном ронилачком опремом (SCUBA), у зависности од дубине. Врсте и бројност риба ронилац биљежи на таблама за подводно писање.
Током 2025. године Институт је, за потребе ЈПМД, спровео праћење рибљих популација у Парку природе „Стари Улцињ“, као и мониторинг керње у Парку природе „Катич“, са посебним освртом на недорасле јединке.
Извор: УЦГ
